Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL6

SIDT1, SID1 transmembrane family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIDT1Q9NXL6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIDT1Q9NXL6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIDT1Q9NXL6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIDT1Q9NXL6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIDT1Q9NXL6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIDT1Q9NXL6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SIDT1Q9NXL6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIDT1Q9NXL6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIDT1Q9NXL6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms