Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR3EQ9NVU0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR3EQ9NVU0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR3EQ9NVU0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms