Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DCAF13Q9NV06 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
DCAF13Q9NV06 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DCAF13Q9NV06 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms