Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
RRP7BPQ9NSQ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
RRP7BPQ9NSQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RRP7BPQ9NSQ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RRP7BPQ9NSQ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RRP7BPQ9NSQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms