Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FARSBQ9NSD9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
FARSBQ9NSD9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARSBQ9NSD9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms