Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD7

RXFP3, Relaxin-3 receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXFP3Q9NSD7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RXFP3Q9NSD7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RXFP3Q9NSD7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RXFP3Q9NSD7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RXFP3Q9NSD7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RXFP3Q9NSD7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXFP3Q9NSD7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXFP3Q9NSD7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXFP3Q9NSD7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXFP3Q9NSD7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXFP3Q9NSD7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXFP3Q9NSD7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXFP3Q9NSD7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXFP3Q9NSD7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXFP3Q9NSD7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RXFP3Q9NSD7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms