Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH2B1Q9NRF2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SH2B1Q9NRF2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms