Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGEF3Q9NR81 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms