Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MYO5CQ9NQX4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
MYO5CQ9NQX4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
MYO5CQ9NQX4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
MYO5CQ9NQX4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms