Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ABCB6Q9NP58 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCB6Q9NP58 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCB6Q9NP58 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms