Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRMS1Q9HCU9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
BRMS1Q9HCU9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRMS1Q9HCU9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms