Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CBX8Q9HC52 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CBX8Q9HC52 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBX8Q9HC52 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms