Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBI1

PARVB, Beta-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVBQ9HBI1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PARVBQ9HBI1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PARVBQ9HBI1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARVBQ9HBI1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms