Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FNDC4Q9H6D8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FNDC4Q9H6D8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms