Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRDM12Q9H4Q4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRDM12Q9H4Q4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRDM12Q9H4Q4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms