Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0R8

GABARAPL1, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL1Q9H0R8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABARAPL1Q9H0R8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABARAPL1Q9H0R8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms