Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SHARPINQ9H0F6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHARPINQ9H0F6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms