Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRINP2Q9C0B6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRINP2Q9C0B6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRINP2Q9C0B6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRINP2Q9C0B6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRINP2Q9C0B6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRINP2Q9C0B6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRINP2Q9C0B6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRINP2Q9C0B6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRINP2Q9C0B6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRINP2Q9C0B6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRINP2Q9C0B6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRINP2Q9C0B6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRINP2Q9C0B6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRINP2Q9C0B6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BRINP2Q9C0B6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms