Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDEM3Q9BZQ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDEM3Q9BZQ6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDEM3Q9BZQ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms