Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTPBP4Q9BZE4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTPBP4Q9BZE4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GTPBP4Q9BZE4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms