Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
KRTAP3-1Q9BYR8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.5 ms