Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RNF17Q9BXT8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RNF17Q9BXT8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RNF17Q9BXT8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RNF17Q9BXT8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms