Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1QTNF3Q9BXJ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1QTNF3Q9BXJ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1QTNF3Q9BXJ4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms