Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SALL3Q9BXA9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SALL3Q9BXA9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SALL3Q9BXA9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms