Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IFT27Q9BW83 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IFT27Q9BW83 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
IFT27Q9BW83 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
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