Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PBDC1Q9BVG4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PBDC1Q9BVG4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PBDC1Q9BVG4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms