Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRACR2AQ9BSW2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRACR2AQ9BSW2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRACR2AQ9BSW2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms