Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCM2Q9BSQ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2Q9BSQ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCM2Q9BSQ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2Q9BSQ5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms