Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC50A1Q9BRV3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC50A1Q9BRV3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms