Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLSTN3Q9BQT9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLSTN3Q9BQT9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLSTN3Q9BQT9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLSTN3Q9BQT9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms