Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHDC3Q9BQ90 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHDC3Q9BQ90 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHDC3Q9BQ90 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHDC3Q9BQ90 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms