Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
KCNS3Q9BQ31 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNS3Q9BQ31 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNS3Q9BQ31 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms