Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PSMD1Q99460 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PSMD1Q99460 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSMD1Q99460 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms