Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CICQ96RK0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CICQ96RK0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CICQ96RK0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CICQ96RK0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms