Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FAM227BQ96M60 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM227BQ96M60 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM227BQ96M60 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM227BQ96M60 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms