Protein–RNA interactions for Protein: Q96LA6

FCRL1, Fc receptor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCRL1Q96LA6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FCRL1Q96LA6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FCRL1Q96LA6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FCRL1Q96LA6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms