Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCC12Q96J65 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCC12Q96J65 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ABCC12Q96J65 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCC12Q96J65 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms