Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN17Q96FV3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN17Q96FV3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN17Q96FV3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms