Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00526Q96FQ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00526Q96FQ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms