Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LINGO1Q96FE5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LINGO1Q96FE5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LINGO1Q96FE5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms