Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM44Q96DX7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM44Q96DX7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM44Q96DX7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms