Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PABPC5Q96DU9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PABPC5Q96DU9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC5Q96DU9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms