Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
OTUB2Q96DC9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTUB2Q96DC9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTUB2Q96DC9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms