Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK4Q96C45 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK4Q96C45 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ULK4Q96C45 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ULK4Q96C45 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms