Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBE2E3Q969T4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2E3Q969T4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2E3Q969T4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms