Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TOP1MTQ969P6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TOP1MTQ969P6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOP1MTQ969P6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms