Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF34Q969K3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF34Q969K3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF34Q969K3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms