Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC9A6Q92581 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC9A6Q92581 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms