Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RGP1Q92546 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RGP1Q92546 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RGP1Q92546 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms