Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ73

RFFL, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFFLQ8WZ73 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFFLQ8WZ73 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFFLQ8WZ73 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFFLQ8WZ73 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFFLQ8WZ73 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms